Der Technopark Zürich ist rein privatwirtschaftlich finanziert und wird durch zwei komplementäre Organisationen geleitet: die Technopark Immobilien AG sowie die Stiftung Technopark Zürich.
Sie stellt Raum und Infrastruktur zu marktüblichen Preisen zur Verfügung und gibt Jungunternehmen aktive Starthilfe, z.B. durch Staffelmieten, welche sie in der Aufbauphase finanziell entlasten.
Die Technopark Immobilien AG ist Eigentümerin des Gebäudes und zuständig für das Gebäudemanagement, das Vermietungswesen, die Verwaltung, die Infrastrukturen, die Veranstaltungsbetreuung, die Öffentlichkeitsarbeit / Werbung sowie die Finanzierung.